sh.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • harvard-anglia-ruskin-university
  • apa-old-doi-prefix.csl
  • sodertorns-hogskola-harvard.csl
  • sodertorns-hogskola-oxford.csl
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
The Homeobox Genes of Caenorhabditis elegans and Insights into Their Spatio-Temporal Expression Dynamics during Embryogenesis
Södertörns högskola, Institutionen för naturvetenskap, miljö och teknik. Karolinska Institutet.
Södertörns högskola, Institutionen för naturvetenskap, miljö och teknik. Karolinska Instiututet.
Södertörns högskola, Institutionen för naturvetenskap, miljö och teknik. Karolinska Institutet.
Södertörns högskola, Institutionen för naturvetenskap, miljö och teknik. Karolinska Instiutetet.
Visa övriga samt affilieringar
2015 (Engelska)Ingår i: PLOS ONE, E-ISSN 1932-6203, Vol. 10, nr 5, artikel-id e0126947Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Homeobox genes play crucial roles for the development of multicellular eukaryotes. We have generated a revised list of all homeobox genes for Caenorhabditis elegans and provide a nomenclature for the previously unnamed ones. We show that, out of 103 homeobox genes, 70 are co-orthologous to human homeobox genes. 14 are highly divergent, lacking an obvious ortholog even in other Caenorhabditis species. One of these homeobox genes encodes 12 homeodomains, while three other highly divergent homeobox genes encode a novel type of double homeodomain, termed HOCHOB. To understand how transcription factors regulate cell fate during development, precise spatio-temporal expression data need to be obtained. Using a new imaging framework that we developed, Endrov, we have generated spatio-temporal expression profiles during embryogenesis of over 60 homeobox genes, as well as a number of other developmental control genes using GFP reporters. We used dynamic feedback during recording to automatically adjust the camera exposure time in order to increase the dynamic range beyond the limitations of the camera. We have applied the new framework to examine homeobox gene expression patterns and provide an analysis of these patterns. The methods we developed to analyze and quantify expression data are not only suitable for C. elegans, but can be applied to other model systems or even to tissue culture systems.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 10, nr 5, artikel-id e0126947
Nationell ämneskategori
Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:sh:diva-27668DOI: 10.1371/journal.pone.0126947ISI: 000355319400026PubMedID: 26024448Scopus ID: 2-s2.0-84932606751OAI: oai:DiVA.org:sh-27668DiVA, id: diva2:818036
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet, 621-2010-5634Stiftelsen för strategisk forskning (SSF)Wenner-Gren StiftelsernaTillgänglig från: 2015-06-08 Skapad: 2015-06-08 Senast uppdaterad: 2021-06-14Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopusPMC Full text

Person

Hench, JürgenHenriksson, JohanAbou-Zied, Akram MLüppert, MartinDethlefsen, JohanMukherjee, KrishanuTong, Yong GuangTang, LoisBürglin, Thomas R

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Hench, JürgenHenriksson, JohanAbou-Zied, Akram MLüppert, MartinDethlefsen, JohanMukherjee, KrishanuTong, Yong GuangTang, LoisBürglin, Thomas R
Av organisationen
Institutionen för naturvetenskap, miljö och teknik
I samma tidskrift
PLOS ONE
Biologiska vetenskaper

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 184 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • harvard-anglia-ruskin-university
  • apa-old-doi-prefix.csl
  • sodertorns-hogskola-harvard.csl
  • sodertorns-hogskola-oxford.csl
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf